其实就是Flashbuilder 这个笨重的IDE本身的问题，估计是在某些时候使用不当，强制关掉导致一些配置没保存完整导致的。
实验证明，只要删除工作目录下的workbench.xml就可以解决了。
XXX\xx\工作目录\.metadata\.plugins\org.eclipse.ui.workbench\workbench.xml
参考：http://bbs.9ria.com/thread-159277-2-1.html 27楼