多肽是粉末状，一般为白色，有时为灰白色，组成不同，多肽粉末的颜色有差异。比如含有Trp的多肽，有时会有点淡红色；含有FITC/5-FAM标记的多肽为黄色；含有TAMRA标记的多肽为红色；疏水性很强的多肽因为在纯化时加入了DMSO，多肽会有些淡黄色．
多肽一般需要避光保存。长期保存应保存在-20度，短期可以保存在4度。可以短时间室温运输。