结核分支杆菌（Mycobacterium tuberculosis）是肺结核TB的致病菌。人们已经对结核分支杆菌进行了多年研究，但至今还未能全面解析其适应性机制。现在，多家研究机构的一项大型研究，为人们展现了TB致病菌的基础调控网络，文章发表在本周的Nature杂志上。解析细菌的基因调控网络，可以帮助人们理解细菌在宿主体内的生存机制，并在此基础上开发有效的新治疗方式。
据估计，世界上约三分之一的人体内潜伏着TB致病菌，这些致病菌大多在肺部处于休眠状态。仅在2011年，全世界就有八百七十万人患上肺结核，其中一百四十万人死于这种疾病。人们认为，在TB的发病机制中，致病菌对低氧条件的适应非常关键。
“我们希望解析TB致病菌应对宿主环境条件改变的机制，包括对低氧条件的适应和对药物干预的应答，”参与这项研究的David Sherman博士说。“我们需要分析致病菌基因和调控分子的关系，然后才能在此基础上了解致病菌对环境改变的适应。”
ChIP-Seq技术可以用来分析蛋白与DNA的相互作用。研究人员在TB致病菌中，利用上述技术鉴定了50个调控性转录因子与DNA的结合，初步构建了TB基因的调控图谱。这一调控网络显示，低氧应答和脂质代谢存在着直接关联，该结论得到了后续实验的验证。
过去也有一些研究将转录因子与基因关联起来，不过据Sherman介绍，这是首次构建综合性的调控网络。“在此之前，还没有人对一个生物的所有转录因子进行ChIP-Seq，”他说。“这是迄今为止最全面的一份基因调控图谱。”
这项研究可以使人们更加系统的看待，TB致病菌中的基因互作。研究人员强调，每一位肺结核研究者，都能从这份基因调控网络中获益。“肺结核研究者们可以在调控图的帮助下，更好的理解目的基因与整体的关系，”他说。“解析不同基因组区域之间的联系。”
研究人员正在对更多转录因子进行研究，不断填充和完善TB致病菌的调控网络。他们希望能够在此基础上，预测药物对致病菌生存能力的影响，加速肺结核特效药的研发。