马氏认为，治疗慢性肝病贵在坚持，不急躁，欲速则不达。肝病患者多病程久，出现虚实夹杂症状，呈本虚标实的身体状态，因此常伴有经络不通、气血不行的病理状态。所以，马氏主张在治疗各种慢性肝病之初先小通、小补，也就是初灸时灸量不宜大，灸疗时间不宜长，否则病体不受，将出现如虚不受补的现象，导致热相上炎，如出现口干、咽痛、头晕、不思饮食等症状。
同时，马氏认为灸治肝病的疗程要足，少则两三个月、半年，甚至更长时间地灸下去。有些肝病，灸后症状消失，但病疾仍未根治，仍要坚持灸至病愈为止。对于慢性肝炎、肝硬化患者，病症消失后，应再坚持灸半年时间以巩固疗效。