1重视人体整体功能的调整
马氏认为，在病患的初期，病变部位以局部为主，此时仅在患处、局部穴位施灸，往往便可起到顿挫病势的效果。但慢性病就不同了，病久会出现经络脏腑的传变，甚至疾病由虚变实，或由实变虚，或者虚实夹杂，往往病情已不限于一经一脏一腑。而多种肝病如慢迁肝、肝硬化、肝功异常、脂肪肝等多病程较长，且呈现虚实夹杂症状。因此，马氏灸治肝病时重视整体配穴，调整人体整体功能，靠机体自身免疫力的增强根除疾病。因此，其治疗肝病采用独特的全身配穴往复循环灸法，选穴重点在肝脾肾经和任脉及肝脏局部穴位。