双系统后问题,不知道怎么解决,一起探讨一下

现在是Windows7系统,我准备安装server12(可以当作是Windows8)系统
但是当安装完之后C盘会被替换,找回后C盘顺序错了,不过这也不影响使用,但是重新开启Windows7之后 再次进入Windows8就无法进入了,进入系统时直接进入修复模式
个人感觉像是硬盘顺序引起的,我记得当初从WindowsXP升级到Windows7可以两个盘(W7系统盘在E盘,C也显示,互不影响),但是在Windows7之下安装新系统这个问题没有被延续而是直接替换了C盘,这个问题很困扰我,因为Windows7系统是工作系统里面基本上文件都放满了,安装的软件都有700多个了反应也有些慢.
实在是想不通该怎么解决了 特地来贴吧请教一下各位