巴西俱乐部费古埃伦斯是菲利佩的母队。此后，他先后效力于荷甲球队阿贾克斯，乌拉圭球队伦蒂斯塔以及西班牙球队卡斯蒂利亚。
2006年，菲利佩以租借身份加盟拉科鲁尼亚，随后正式与球队签约5年。
2010年7月23日，菲利佩加盟马德里竞技，签订五年合约
2014年7月16日，菲利佩转会切尔西，转会费为1600万欧元。