维生素B2　植物性食物中含维生素B2较少，长期素食就容易引起维生素B2缺乏，导致慢性身体虚弱，视力模糊、疲劳、口角炎、舌炎等。
维生素B12　植物性食物中的维生素B12大多缺乏活性，长期素食会导致维生素B12的缺乏症，从而导致巨幼红细胞贫血、抑郁、记忆力下降、四肢震颤等神经系统损害，可增加患心血管病的危险。
铁　植物食品含铁量比荤食高，但吸收差，所以素食者体内铁的含量较低，易导致缺铁性贫血，容易食欲减退、疲乏无力。
钙　完全素食的人钙摄入量低，容易导致老年人骨质疏松，发生骨折。
锌　植物性食物中锌的生物利用率低，素食者锌的摄入量一般比非素食者低。缺乏锌会使老年人的免疫功能下降。
碘　鱼类是人体获取碘的主要食物，长期不吃鱼，容易造成“碘缺乏症”。老年人缺碘可能会患甲状腺肿，甲状腺功能低下、贫血，表情淡漠，无力、易疲劳，体能下降和生活适应能力差等。
蛋白质　植物蛋白的质量比动物蛋白要差些，赖氨酸等必需氨基酸要少些。蛋白质的“营养不良”使人血清总蛋白量及白蛋白降低，会导致身体消瘦、皮肤干涩、头发枯白、消化不良、精神不振、免疫功能下降，容易患感染性疾病，甚至引发肿瘤。
热量低：长期素食，由于蛋白质与脂肪严重不足，容易引发营养不良。长期吃素的女性所生的孩子往往存在生长发育障碍。蛋白质是建造和修补人体组织的主要原料，长期缺乏则对机体的抗病能力影响极大；脂肪产热量高，不饱和脂肪酸更是“人脑的食粮”，对促进大脑智力发展极为重要。所以长期素食对生长发育迅速的青少年危害较大。
记忆力减退：很多上了年纪的人怕患高血压、糖尿病等慢性疾病，所以改吃素食，不过根据美国最新医学研究显示，长期吃素会因缺乏蛋白质及维生素B12等营养素，导致记忆力减退、精神萎靡、反应迟钝、疲劳等症状。
导致视幻觉 ：长期吃纯素者，导致维生素B12严重缺乏，进而出现特殊的视幻觉。
诱发心血管疾病 ：一项研究发现，素食者血中总胆固醇及LDL－胆固醇(坏胆固醇)比杂食组低，但是吃全素者维生素B12摄取比杂食者少了18倍，反而会诱发心血管疾病发生。