ubuntu14.04+gnome3.12透明问题

现在使用gnome3.12
设置透明出现了问题。
在通常情况下不透明，如下图

在有窗口弹出时，变为透明。。

如何解决？？或者怎样美化一下？？
因为把透明关了不太好看。
把背景颜色加深后的效果着这样的：

(标题栏颜色变化是因为我换了主题.)
怎么破??