盐酸克林霉素是克林霉素的盐酸盐，克林霉素磷酸酯是将克林霉素磷酸酯化以后得到的。
两者的有效基团都是克林霉素。盐酸克林霉素进入体内以后，可以直接产生药效，而克林霉素磷酸酯则要水解释放出克林霉素才能产生药效。加磷酸酯的作用，我理解是可以控制药理活性，减少不良反应。
克林霉素磷酸酯进入人体后要分解为克林霉素才能发挥药效，但是克林霉素磷酸酯的药效是克林霉素的很多倍，可能与在体内的分解部位有关。就比如有些药物改为脂溶性的制剂后疗效成倍增加的原理是一样的。
克林霉素磷酸酯凝胶用于治疗寻常痤疮，克林霉素磷酸酯凝胶具有抑制痤疮丙酸杆菌、颗粒丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌等的生长作用。克林霉素磷酸酯凝胶吸收后通过水解成克林霉素发挥抗菌作用，对痤疮丙酸杆菌具有较好的抗菌活性。克林霉素磷酸酯凝胶还可使皮肤表面的脂肪酸减少，从而有利于痤疮的治疗。
作用一样。关键在于前者易吸收且不良反应较后者少。
说明：克林霉素磷酸酯凝胶属于是抗生素类的药物， 不含激素。 用药后也不会产生依赖， 但是长期用药也有导致细菌产生耐药性的可能。
在百度上搜索到的关于盐酸克林霉素和克林霉素磷酸脂的区别，希望对大家有帮助。