在《方法论》中,笛卡尔提出哲学家必须使用特定的方法来解决哲学问题。是的,笛卡尔希望用“数学方法”来进行哲学性的思考。笛卡尔认为除非我们能够清楚分明地知道某件事情是真实的,否则我们就不能够认为它是真的。他的目标是希望能在生命的本质这个问题上获得某种确定的答案。他的第一步是主张在一开始时我们应该对每一件事都加以怀疑。笛卡尔并不认为怀疑一切事物是合理的,但他以为从原则上来说怀疑一切事物是可能的。笛卡尔认为,在他开始建构自己的哲学体系以前,必须先挣脱前人理论的影响。“在兴建一栋属于自己的新房子之前,他想清除房屋地基上的所有旧瓦砾……”。笛卡尔所怀疑的还不止于前人的理论。他甚至认为我们不能信任自己的感官,因为感官可能会误导我们。当我们做梦时,我们以为自己置身真实世界中。那么,我们清醒时的感受与我们做梦时的感觉之间有何区别呢?笛卡尔写道:“当我仔细思索这个问题时,我发现人清醒时的状态与做梦时的状态并不一定有所分别。”他并且说:“你怎能确定你的生命不是一场梦呢?”所以,笛卡尔最终怀疑每一件事物。这种怀疑一切的思想被称为“笛卡尔式的怀疑”。他怀疑每一件事,而这正是他唯一能够确定的事情。此时他悟出一个道理:有一件事必定是真实的,那就是他怀疑。当他怀疑时,他必然是在思考,而由于他在思考,那么他必定是个会思考的存在者。用他自己的话来说,就是:Cogito, ergo sum.