胶原蛋白肽还在治疗骨关节炎和骨质疏松症中具有潜在的效用。欧洲食品安全管理局膳食、营养和过敏专家组认为，胶原蛋白肽能保持身体的关节健康，是一种有益的生理效应。
口服胶原蛋白肽经吸收循环后能在软骨积累。该机制可能有助于饱受关节疾病折磨的关节病患者；膳食补充水解胶原蛋白肽的受试者能有效缓解关节疼痛以及关节恶化的风险；对骨质疏松症患者而言，降钙素加药物级胶原蛋白肽比单独使用降钙素更能抑制骨胶原蛋白的分解。
胶原蛋白肽已在美国、欧盟、日本和中国等国家和地区进行多年的销售和食用，其保健作用已被广泛认可。胶原蛋白肽产品经过中国食品药品监督管理局认证，为安全可靠的食品。在此基础上，有部分产品进一步进行了功效方面的验证，并通过了严格的国家保健品检验程序，获得了保健品批号，已确认具有保健功效。