故事讲述了一个跨越千年的翼人传 说。 一位懂“法术”的、以表演人偶为生 的青年国崎往人，一天来到一个海边小 镇，遇上了主角的神尾观铃而展开的故 事。国崎往人和他的祖先们一直都在找 一位在天空中有翼的女孩子，而在和观 铃一路相处之下，观铃可能就是他要寻 找的女孩子。
在古日本有位背上长上 一对翅膀的女孩子（称为翼人）神奈备 命，给人视为不详的象征所以被人软禁 着。后来遇上了被派来“保护”她的柳 也，和女官里叶一起去寻找母亲（八百 比丘尼）。可惜最后母女两人也被人杀 死，神奈是在空中给人乱箭射死。可是 死后她没有掉下来，而是在空中飘浮 着，并且受到诅咒，堕入无限的轮回。 里叶和柳也为了帮助神奈，决定为了神 奈，要诞下后代来替自己完成心愿。 1000年后也就变成了翼人传说。 而观 铃就是继承了翼人的女孩，往人（和其 祖先）则是柳也他们的后代，而原作中 出现的佳乃和美凪则是和从翼人的翼掉 下来的羽毛所影响的人物。
故事的重心是“家族爱”（亲情）