魔力を増幅させるための装置としての剣が世の中を支配している异世界。そこでは贵重とされているヤマトの血脉を持つ如月武琉は、周囲の生徒达の注目を浴びながら、同じくヤマト民族の咲耶との同居生活を送っていた。ある日、ルシアのエリヴィラ、アーニャの二人に、自国に来ないかと诱われるが、武琉は咲耶のことを思って断ってしまう。そして、封剣学园全体で行われる武术大会、神剣刀争の予选が始まる。学科毎で行われる予选は炽烈なものだったが、それでも武琉は顺调に课题を突破していく。だが、そこに袭撃者が现れて……。「胜てる気しかしねえよ」各国のエリート达が集い乱れる学园バトル无双幻想曲、第二幕！