“奇行种”中的线索：奇行种是某个调查兵在最后的笔记中描述的一种巨人。在故事中，一个失去武器的调查兵遭遇到了该巨人，然而巨人没有立刻吃掉他，而是表现出了某种敬畏的姿态，伏地膜拜，并不断用人类语言说着“由留美的人民”“由留美大人”“太好了”。
这段故事，除了表达巨人有可能有一定的智商外，还提示了：巨人(或者巨人中的一部分）和墙里的人类并不是对立的.由于该奇行种智商有限，所以更能反映巨人的原始立场（因为太傻了不懂得掩饰内心，表现能最真实的反应出心里的态度，就像屌丝一见女神就智商为负本能舔跪一样）。它敬畏墙内的人，一定来源于百年前它的立场和态度。它见到墙内人很激动（说着太好了），说明它对人类是有认同感和需求的。而最后调查兵像对待怪物一样的态度，让它的某个信念坍塌，内心崩溃发狂而吃人。
墙中的线索： “墙内有巨人，或者说，墙本身就是巨人”。如果巨人全部都是人类天敌，怎么可能建立起保护人类的高墙？以人类的实力，是不可能用武力逼迫巨人手牵手围成三个圈硬化成长城的，而巨人如果没有智商，也不大可能有秩序的手拉手围成墙再集体硬化（无脑巨人只会吃，走，扑街）；所以这种自我牺牲的行为一定有巨人的主观意识在里面。这也说明了有部分巨人对人类的态度并不是“敌对”的。城墙教或者部分知道内情的人，表现出了某种对墙的崇拜，除了是由于自己的生命受到墙的保护外，也有为这些巨人的牺牲而敬仰的心情吧。
巨人变身的线索： 无脑巨人和智慧巨人：无脑巨人很多（包括奇行者也算无脑巨人），智慧巨人则无一例外都可以还原为人类姿态。同时无脑巨人也可能变为智慧巨人。 从人类到智慧巨人，有三种方法：
1.人类，打针，变成智慧巨人（如主角）
2.人类，由于某种血缘关系，能变成智慧巨人（如内奸三人组，他们都是同乡）
3.人类，由于某种原因变成无脑巨人，然后吃了智慧巨人后，重新获得意识，变成智慧巨人（如某毒舌女）
而另外一方面，如果智慧巨人过度暴走，也有可能变成无脑巨人。以上情报说明，人类，巨人实际上是同种生物。
巨人吃人的线索： 无脑巨人会无意识的主动吃人，而智慧巨人则没有吃人的需求（杀人为目的的行为另算）。 为什么巨人有吃人的举动呢，从某个无脑巨人变毒舌女的剧情，我推测，吃人是因为无脑巨人本能的需要一种物质，这种物质可以刺激巨人的大脑获得某种满足感。而一旦这种刺激足够巨大，可以唤醒巨人的大脑机能，使它重获智力。 而普通人和智慧巨人中，都含有该物质，特别是智慧巨人富含该物质，所以不需要吃人（杀人另算）也能行动。也正是由于这点，无脑巨人吃掉智慧巨人后，会获得“巨人之力”，因为它获得了大量该物质。
以上线索串起来，我的大背景推测如下：
古人（高科技人）发明了一种生物武器，可以把人类强化变成巨人。然而该武器有缺陷，作用在人体后，会阻断大脑产生某种元素，会导致智能的退化，变成无脑巨人。当然，事情也有例外，部分人也能成功变成智慧巨人。这部分人就成了国家的终极武器（战士）。
某一天，实验/战争/武器失控或者别的原因，导致事态恶化了，生物武器在民间大量扩散，制造出了大量的无脑巨人。即便有战士巨人的存在，也没法遏制人类的颓势。所以部分高层商量出一个计划，就是召集所有战士，硬化出长城，在灾难中划出人类最后的乐园---这就是主角世界的三道墙。幸存的人类在墙里，研制生物武器的解药（主角的父亲也许就是这个计划的执行者之一），日后解放墙外被感染的人类，并解放墙里硬化的战士，让他们从新为人。 但是这个计划似乎被主动或者被动的遗忘了，高层也不愿意承认是由于自己造成了巨人危机，所以对民众一直是欺骗态度（不告诉他们巨人的来历和墙的真相）。所以100年过去了，解药依然没有使用。
为了保障墙内人类的安全，所有能变身成巨人的家族都被派往墙外做影子防线，在暗地狙击巨人；同时也是为了防止他们突然暴走攻击墙内的人。这样的战士就是“故乡的人”，其实也就是被人类牺牲掉的智慧巨人。
智慧巨人家族都在等待高层实现他们的诺言，研制解药，净化世界。然后苦等也没有任何消息。有的巨人逐渐退化成无脑巨人，有的则过着类似人类的田园生活。（其实一样被巨人袭击，比如某奸细，家乡就被无脑巨人夜袭）巨人在夜晚无法行动，除非有猴子巨人（原始巨人）的帮助，所以战士家族在夜袭中被屠杀了。
这就导致了奸细三人组进城找解药的剧情（找主角拿钥匙）
所以，进击的巨人，其实是牺牲者们自救的故事。