园林工程系是菏泽学院办学经验丰富、师资力量雄厚、教学质量高、科研能力强、发展前景广阔的系科之一，具有较强的发展潜力和鲜明的办学特色。现有本专科在校生941人（其中本科生551人，专科生390人），教师46人，其中教授1人，副教授15人，讲师24人；硕士以上学历教师39人，其中博士3人，在读博士4人，占专职教师总数的80%以上；有1人被评为山东省教学名师，1人享受国务院政府津贴。
园林工程系重视专业学科建设，课程设置不断完善。现有3个本科专业：园林、食品科学与工程、艺术设计（景观设计方向）；三个专科专业：环境艺术设计、园艺技术、艺术设计（景观设计方向）。在教学中，强化基础理论教学，注重理论与实践相结合，培养学生的创新能力、实践操作能力和解决实际问题的能力，毕业生深受用人单位欢迎。我系加强同社会的联系，积极开展对外学术交流与项目合作，聘请学术造诣深厚的专家学者做兼职教授。现今，我系园林植物与观赏园艺是菏泽学院重点学科；《食用菌栽培学》、《花卉学》和《植物生理学》是校级精品课程；园艺科学教学团队是菏泽学院优秀教学团队。食品安全与检测实验室是学校重点实验室。
园林工程系科研成果丰硕，近年来在各类核心期刊上发表论文300余篇，出版专著5部，教材16部，专利6项；完成省级以上课题6项，市级以上课题63项，获省、市科研成果奖52项。其中荣获山东省科技进步三等奖一项。选育新品种一个，并获得了新品种证书，填补了菏泽市建国以来林业新品种的历史空白。
近年来，学校十分重视园林工程系的建设与发展，先后投资320多万元，增建扩建了教学实验设施，购置了大批仪器设备。现设有园林实验教学中心1个，下设景观规划、园林植物、园艺、食品工程4个实验室，计算机辅助设计、工程制图、建筑设计、食品工艺等25个实验室分室。建立了100多处教学科研实习基地，为增强学生的实践创新能力创造了良好的条件。现设有菏泽学院景观规划设计院，菏泽学院园林绿化服务中心，菏泽学院牡丹工程中心，菏泽学院食品质量检测中心，菏泽学院观赏园艺研究所等科研机构。由我系承办的“天香园艺”劳务培训中心在2007年10月“山东省首批驰名劳务品牌”评选中，当选为“山东省首批驰名劳务品牌”，我系承办的国家人社部和国家林业局批准的林业行业特有工种职业技能鉴定站，现正开展景观设计师、室内装饰设计人员、风景园林工程技术人员、花艺环境设计师、装潢美术设计人员、花卉园艺师、绿化工、制图员、插花员、标本员、室内成套设施装饰工、装饰装修工、食品检验工、观赏动物饲养员、动物疫病防治员、动物检疫检验员等100多个工种的高层次鉴定工作，为菏泽市地方乃至山东省社会经济发展作出了积极贡献。
多年来，园林工程系主动更新教育观念，积极探索教学内容与课程体系的改革，注重研究和应用新的教学方法和现代化的教学手段，不断提高教学质量，逐步形成了适应新形势要求的人才培养模式。近几年，我系多次获得师德建设先进单位、平安校园建设先进单位、优秀基层党组织、大学生艺术文化节优秀组织单位、田径运动会优秀组织奖及道德风尚奖、工会工作及宣传工作先进单位、就业工作先进单位、资产管理先进单位等荣誉称号。