众议院弹劾
因为肯·斯塔尔已经提供了较为完整而广泛的调查，所以众议院司法委员会并未亲自对克林顿的自我辩解进行调查。这件事在1998年中期选举之前也并没有引起过多变故。然而在选举中，总统弹劾案成了重要的议题之一。在1998年11月，重新拿回了国会的大量席位。（1994年的中期选举中，克林顿的民主党大崩溃，虽然在96年11月又获得了8个席位，但仍然处于劣势）
虽然在98年的中期选举之后，共和党依然拥有众议院的大多数席位，但此役中他们损失了不少席位 。在中期选举之后不久，众议院发言人，同时也是力主弹劾克林顿的人 之一的纽特·金里奇发表声明。他在声明中说，一旦找到合适的继任者，他将立刻从国会辞职。99年1月25日，金里奇兑现了他的诺言，正式从国会辞职。在弹劾讨论中，金里奇私下做的民意调查发现，克林顿的丑闻会使共和党在98年的中期选举中获得6到30个额外的众议院席位。
弹劾进程在大选后的第105届美国国会落选人会议上正式开始。听证委员会的态度略显敷衍，但是场下的议员们却大有分庭抗礼之势。未上任的新闻发言人，鲍勃·利文斯顿议员（同时也是共和党选出的金里奇的继任者），在他自己的婚姻丑闻曝光之后发表声明放弃了他的候选人资格，并从国会辞职。但在这次声明中，利文斯顿也同时建议克林顿辞职。但克林顿选择继续留在白宫，并劝说利文斯顿收回辞职申请。在出版商拉里·弗林特的悬赏公布后，很多杰出的共和党成员（包括印第安纳州的丹·伯顿，爱达荷州的海伦·切诺维斯和伊利诺伊的亨利·海德等）都被爆出婚姻丑闻。因此很多克林顿的支持者指责共和党的伪善。
在H. Res. 611的基础上，克林顿的弹劾案由众议院于1998年12月19日通过（其中伪证罪以228对206通过，妨碍司法公正罪以221对212通过，而在普拉案中的伪证罪以205对229被否决，滥用职权罪以148对285否决。4名共和党成员对四项指控均投了反对票，同时有5位民主党员投票支持其中的三项指控，甚至还有1位民主党员支持全部四项指控。
克林顿因此成为美国历史上第一位被弹劾的由人民选出的总统，同时也是1868年安德鲁·约翰逊弹劾案之后被弹劾的第二位美国总统。（安德鲁·约翰逊总统是当时的副总统，在1865年林肯总统被刺身亡后以第一顺位继承总统，因此并非人民选出的总统。此外理查德·尼克松也曾在1974被提起弹劾，但他在众议院表决前就已经辞职）

克林顿的辩护律师是
谢丽尔·米尔斯。他的法律顾问团成员包括查尔斯·拉夫、大卫·肯德尔、戴尔·邦普斯、布鲁斯·林赛、尼古拉·塞利格曼、兰尼·布洛伊尔以及乔治·克雷格

首席公诉人亨利·海德对此反驳道：
“未能给总统定罪，会使违背就职宣言这样一种讨厌的而应该避免的行为看起来不那么严重。只要你是总统，违反就职宣言就成为一种违反了礼节的行为。现在让我们所有人从历史的荣誉出发，发挥我们的作用，噢，是的，秉公办事。

伪证罪以45票“有罪”（全部来自共和党）对55票“无罪”（45位民主党人和10位共和党人）遭到否决。
妨碍司法公正罪以50票“有罪”（全部为共和党人）对50票“无罪”（45位民主党人和5位共和党人）同样遭到否决。而两项决议均需要达到三分之二多数才能认定有罪。

结果
蔑视法庭
1999年4月，被参议院宣判无罪大约两个月后，克林顿被美国联邦地方法院法官苏珊·韦伯·赖特传讯为他的“故意失败”而服从她的三令五申，如实作证普拉·琼斯提出的性骚扰诉讼为民事藐视法庭。对于这次传讯，克林顿被判定90000美元的罚款，此事被送交阿肯色州最高法院判定是否应给予纪律处分。
关于1998年1月17日克林顿宣誓证词，法官写道：
“简单地说，总统的关于他是否与（莫妮卡）莱温斯基女士独处过的宣誓证词是故意造假，并且他的有关他是否与莱温斯基女士有过性关系的陈述，同样是故意造假......”
2001年1月，克林顿在卸任前一天，作为独立律师的停止调查协议的条件，他同意将他的阿肯色州律师执照吊销五年。在被吊销执照后，克林顿被自动从美国最高法院停职，然后他选择了辞职。

与普拉的和解
在最终审判之前，法院驳回普拉·琼斯提起的骚扰诉讼，理由是琼斯没有指出任何损害。然而，驳回上诉时，克林顿同意支付琼斯$ 850,000进行庭外和解。

政治影响
在1998年和1999年初进行的民意调查显示，只有约三分之一的美国人支持克林顿的弹劾或定罪。然而，一年后，当众院弹劾明显不会导致的总统下台时，一半美国人在一项由CNN、《今日美国》、盖洛普进行的民调中表明他们支持弹劾，42％人反对参议院不罢免总统的决定。
但是有批评指责主流媒体，在布什和戈尔的竞选活动于1999年开始后，歪曲事实，从而帮助得克萨斯州州长乔治·沃克·布什赢得2000年总统大选。作为“报告的准确性和公平性（FAIR）”组织的两位评论员，彼得·哈特和吉姆·纳莱卡斯，把媒体称为“一群言过其实者”，并指出多家媒体不断夸大对戈尔的批评，如声称戈尔谈到他在佛罗里达州萨拉索塔的一个拥挤的科学课堂上的讲话是说谎。而在某些事件上却掩护布什，如布什在2000年10月与戈尔的第二次辩论中严重夸大了他在德克萨斯州年度预算中，保证给予无保险人员的钱款。在2000年4月专栏作家罗伯特·佩里在“华盛顿月刊”中指出，一些媒体夸大了戈尔在1999年11月30日，在新罕布什尔州康科德的竞选演说，声称的戈尔说他在纽约州尼亚加拉大瀑布市“发现”爱河社区，而事实上期间他只声称他再次“找到”了因化学污染而在1978年被完全疏散的爱河社区。 “滚石” 的专栏作家埃里克·伯乐特也认为，早在1999年7月22日媒体就夸大了对戈尔的批评 ，当时戈尔身为环保主义者，却为了照相而让朋友将5亿加仑的水放到一条干涸的河中以帮助使他的船保持飘流，然而媒体夸大了被注入的水实际总量，并声称注水量为40亿加仑。

然而斯坦福的分析同时也带来了不同的理论，他们认为，戈尔落选是因为他决定自己在竞选期间远离克林顿。 作者点评道 ：
“我们发现，戈尔常被人诟病的个性并不是他表现不佳的原因。相反，主要的原因是由于克林顿政府的表现使他未能获得任何优势。”
据美国未来基金会：
“在克林顿丑闻之后，独立人士促使布什的承诺“恢复白宫的荣誉和尊严”。 根据选民新闻服务，选民最关心的个人素质是“诚实”。选择“诚实”的选民中选布什的人数超过选戈尔人数的4倍。44％的美国人说，克林顿丑闻影响了他们的投票。当然，这其中布什获得了四分之三的支持。