葛尔丹和清朝
噶尔丹本是喇嘛教教徒，一心想建立一个以喇嘛教为国教的准噶尔蒙古帝国。于是，他在1678年率兵攻灭了叶尔羌汗国。同时，又出兵哈萨克，巩固了在那里的统治。
之后于康熙二十七年，在沙俄的支持下率领3万大军，越过杭爱山，向漠北喀尔喀蒙古地区进攻，和清朝争夺漠南、漠北。
并在1690年，攻入喀尔喀漠北蒙古，长驱东进，直取重镇乌珠穆沁，然后拨转锋芒，在赤峰附近的乌兰布通南下，沿成吉思汗故道准备进军中原。
蒙古诸部被葛尔丹打得不行，于是联名向清朝的康熙皇帝求救，同时雄才大略的康熙皇帝也有意解除准格尔人对帝国的威胁，决定消灭葛尔丹。
在出兵前康熙皇帝做了三件事：
1
出使沙俄，迫使沙俄放弃对葛尔丹的军事援助。尤其是新装备的3000支滑膛火枪。由于在雅克萨一战中沙俄吃了很大苦头，又在边界谈判中获得清朝的让步，于是就中断对葛尔丹的军火供应。
2
联合了流浪的策妄阿拉布坦，让他以正统准格尔汗的名义在葛尔丹的背后插上一刀。策妄阿拉布坦起兵之后，很快攻占准格尔全境，葛尔丹的老巢被掀掉了，最重要的后勤基地被断绝。
3
命令理藩院尚书阿剌尼和兵部尚书纪尔他布率领6800清军，携带16门红衣大炮到归化(今呼和浩特)，会合忠于清朝的蒙古军，切断葛尔丹的后路。同时命令蒙古科尔沁亲王在内蒙科尔沁草原集结两万骑兵，阻止葛尔丹东进辽阳。这样，就为葛尔丹编制了一个庞大的天罗地网。
在做充分准备以后，于康熙三十五年（1696年）亲征准格尔。
在这之前，葛尔丹击败阿剌尼轻敌冒进的前锋700人，于是士气大骄，挥师继续南下，于8月31日，抵达距离北京不到600里的乌兰布通。而此时，康熙皇帝已经在这里布置展开了十万大军。清军万炮齐轰，葛尔丹主力被歼，大败而逃。其后的康熙三十六年（1697年）康熙皇帝于宁夏率领20万大军再次亲征。噶尔丹这次彻底失败，服毒自杀。第二年年9月，策妄阿拉布坦遣使清朝，献上噶尔丹尸体，双方暂时议和。策妄阿拉布坦于康熙三十八年（1699年）登上准格尔汗位。
策妄阿拉布坦在位时期，准格尔汗国达到顶峰。
他在1699年向西征服哈萨克汗国，1717年向南征服西藏，并支持青海的蒙古亲王罗卜藏丹津叛乱，但不久被年羹尧平定。
策妄阿拉布坦于1727年去世，其子噶尔丹策零继位。噶尔丹策零先后击败了沙俄和清朝的进攻，于乾隆十年（1745）去世。

盛世才派人用高官厚禄相利诱马全禄的部下马德祥。
马德祥反水并杀死马全禄，带着马全禄余部2000多人投奔盛世才，从而消除了威胁迪化的一大威胁。
然后盛世才又利用马仲英和霍加尼牙孜因为分配战利品而发生的分歧和矛盾，以划分南疆给霍加尼牙孜为代价，诱使和加尼牙孜与马仲英脱离关系，这样和马联盟瓦解，马仲英从此失去了当地部分少数民族头目的支持
但是最终让盛世才胜利的，还是第三步。