GDI一度发现了一个“外星飞船”，这个庞大的飞船能抵抗任何人类武器的攻击。但是当GDI前往飞船查看时竟然发现飞船已经被洗劫一空。他们意外的邂逅了一个女变异人，变异人告诉麦克尼尔，凯恩从飞船上偷走了一些东西。 　　其实GDI发现的那个飞船是NOD在第一次泰伯利亚战争后期仿制的。原始的外星飞船已经被兄弟会秘密摧毁。[3] 　　NOD的计划是使用高度纯化的泰伯利亚导弹轰击整个地球，使整个地球的生物都变成泰伯利亚基础的生物。最后的战斗在开罗爆发，GDI再次攻击NOD的心脏地带，包括凯恩的金字塔和被重建的NOD神殿，瘫痪了泰伯利亚导弹。麦克尼尔和凯恩进行了一场决斗，在最后凯恩被一根钢梁刺穿。 GDI最后占领了一台神秘的塔西佗设备(Tactius Device)，它可能拥有摧毁泰伯利亚的技术，并解决泰伯利亚所衍生的问题。