临床上，很多患者得了急性肠炎都不及时去治疗，从而延误了治疗时机。专家指出，急性肠炎治疗不彻底是造成慢性肠炎的主要原因之一。慢性肠炎可由急性肠炎迁延或反复发作而致，病程多在2个月以上。此外，长期过度疲劳、情绪激动、过度精神紧张，加上营养不良，饮食不节，都是慢性肠炎的诱因。慢性肠炎久治不愈会引发营养不良、贫血在内的多种慢性病。研究发现，患溃疡性结肠炎10年以后，癌变的危险将呈倍数增加。许多学者在学术报告中也均提到，青少年时患溃疡性结肠炎，在中年后易患肠癌。
肠炎治疗中存在严重的抗生素滥用，从而引发二次损伤。长期使用此类药物治疗慢性肠炎主要有三大弊病。首先，易产生耐药性，使药效大打折扣。其次，对胃肠道刺激大，会加重肠粘膜的损坏。此外，长期使用抗生素会严重破坏肠道菌群平衡，出现其他疾病。所以说长期滥用抗生素或者消炎药，难以达到理想的治疗效果，目前临床上已经倡导尽量不用或少用。
上海徐浦中医医院专家提醒：注意饮食对治疗顽固性肠炎（结肠炎）很重要。得了慢性肠炎，除针对病因积极治疗外，还要安排好饮食。低脂、少纤维，忌酒及辛辣刺激物。少量多餐，持续3个月以上。
