王尊字子赣，涿郡高阳人也。少孤，归诸父，使牧羊泽中。尊窃学问，能史书。年十三，求为狱小吏。数岁，给事太守府，问诏书行事，尊无不对。太守竒之，除补书佐，署守属监狱。乆之，尊称病去，事师郡文学官，治尚书、论语，略通大义。复召署守属治狱，为郡决曹史。数岁，以令举幽州刺史从事。而太守察尊廉，补辽西盐官长。数上书言便冝事，事下丞相御史。
初元中，举直言，迁虢令，转守槐里，兼行美阳令事。春正月，美阳女子告假子不孝，曰：「儿常以我为妻，妬笞我。」尊闻之，遣吏收捕验问，辞服。尊曰：「律无妻母之法，圣人所不忍书，此经所谓造狱者也。」尊于是出坐廷上，取不孝子县磔着树，使骑吏五人张弓射杀之，吏民惊骇。
后上行幸雍，过虢，尊供张如法而办。以高弟擢为安定太守。到官，出敎告属县曰：「令长丞尉奉法守城，为民父母，抑强扶弱，宣恩广泽，甚劳苦矣。太守以今日至府，愿诸君卿勉力正身以率下。故行贪鄙，能变更者与为治。明慎所职，毋以身试法。」又出敎敕掾功曹「各自厎厉，助太守为治。其不中用，趣自避退，毋乆妨贤。夫羽翮不修，则不可以致千里；闑内不理，无以整外。府丞悉署吏行能，分别白之。贤为上，毋以富。贾人百万，不足与计事。昔孔子治鲁，七日诛少正卯，今太守视事已一月矣，五官掾张辅怀虎狼之心，贪污不轨，一郡之钱尽入辅家，然适足以葬矣。今将辅送狱，直符史诣合下，从太守受其事。丞戒之戒之！相随入狱矣！」辅系狱数日死，尽得其狡猾不道，百万奸臧。威震郡中，盗贼分散，入傍郡界。豪强多诛伤伏辜者。坐残贼免。
起家，复为护羌将军转校尉，护送军粮委输。而羌人反，绝转道，兵数万围尊。尊以千余骑奔突羌贼。功未列，坐擅离部署，会赦，免归家。
涿郡太守徐明荐尊不冝久在闾巷，上以尊为郿令，迁益州刺史。先是，琅邪王阳为益州刺史，行部至邛郲九折阪，叹曰：「奉先人遗体，柰何数乗此险！」后以病去。及尊为刺史，至其阪，问吏曰：「此非王阳所畏道邪？」吏对曰：「是。」尊叱其驭曰：「驱之！王阳为孝子，王尊为忠臣。」尊居部二岁，怀来徼外，蛮夷归附其威信。博士郑宽中使行风俗，举奏尊治状，迁为东平相。
是时，东平王以至亲骄奢不奉法度，傅相连坐。及尊视事，奉玺书至庭中，王未及出受诏，尊持玺书归舍，食已乃还。致诏后，谒见王，太傅在前说相鼠之诗。尊曰：「毋持布皷过雷门！」王怒，起入后宫。尊亦直趋出就舍。先是王数私出入，驱驰国中，与后姬家交通。尊到官，召敕廐长：「大王当从官属，鸣和鸾乃出，自今有令驾小车，叩头争之，言相敎不得。」后尊朝王，王复延请登堂。尊谓王曰：「尊来为相，人皆吊尊也，以尊不容朝廷，故见使相王耳。天下皆言王勇，顾但负贵，安能勇？如尊乃勇耳。」王变色视尊，意欲格杀之，即好谓尊曰：愿观相君佩刀。」尊举掖，顾谓傍侍郎：「前引佩刀视王，王欲诬相拔刀向王邪？」王情得，又雅闻尊高名，大为尊屈，酌酒具食，相对极驩。太后征史奏尊「为相倨慢不臣，王血气未定，不能忍。愚诚恐母子俱死。今妾不得使王复见尊。陛下不留意，妾愿先自杀，不忍见王之失义也。」尊竟坐免为庶人。大将军王凤奏请尊补军中司马，擢为司隷校尉。
初，中书谒者令石显贵幸，专权为奸邪。丞相匡衡、御史大夫张谭皆阿附畏事显，不敢言。久之，元帝崩，成帝初即位，显徙为中太仆，不复典权。衡、谭乃奏显旧恶，请免显等。尊于是劾奏：「丞相衡、御史大夫谭位三公，典五常九德，以緫方略，壹统类，广敎化，美风俗为职。知中书谒者令显等专权擅埶，大作威福，纵恣不制，无所畏忌，为海内患害，不以时白奏行罚，而阿谀曲从，附下罔上，怀邪迷国，无大臣辅政之义也，皆不道，在赦令前。赦后，衡、谭举奏显，不自陈不忠之罪，而反扬着先帝任用倾覆之徒，妄言百官畏之，甚于主上。卑君尊臣，非所冝称，失大臣体。又正月行幸曲台，临飨罢衞士，衡与中二千石大鸿胪赏等会坐殿门下，衡南郷，赏等西郷。衡更为赏布东郷席，起立延赏坐，私语如食顷。衡知行临，百官共职，万众会聚，而设不正之席，使下坐上，相比为小惠于公门之下，动不中礼，乱朝廷爵秩之位。衡又使官大奴入殿中，问行起居，还言漏上十四刻行临到，衡安坐，不变色改容。无怵惕肃敬之心，骄慢不谨。皆不敬。」有诏勿治。于是衡慙惧，免冠谢罪，上丞相、侯印绶。天子以新即位，重伤大臣，乃下御史丞问状。劾奏尊「妄诋欺非谤赦前事，猥历奏大臣，无正法，饰成小过，以涂污宰相，摧辱公卿，轻薄国家，奉使不敬。」有诏左迁尊为高陵令，数月，以病免。