001：云霄飞车杀人事件
128：黑暗组织抢劫10亿事件
129：来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
176：与黑暗组织的再会（灰原篇）
177：与黑暗组织的再会（柯南篇）
178：与黑暗组织的再会（解决篇）
230：迷一样的乘客（前篇）
309：与黑衣组织的接触（交涉篇）
310：与黑衣组织的接触（追踪篇）
311：与黑衣组织的接触（决死篇）
345：与黑暗组织对决 满月之夜的一元二重推理
425：黑色冲击！组织之手逼近的瞬间
464：黑暗组织之影 谜样的高额报酬
465：黑暗组织之影 珍珠流星
497：红与黑的撞击 觉醒
499：红与黑的撞击 伪装
500：红与黑的撞击 遗言
501：红与黑的撞击 嫌疑
502：红与黑的撞击 清白
504：红与黑的撞击 殉职
579：黑与13的暗示
580：逼近黑色时刻
581：红色的摇摆目标
剧场版5：通往天国的倒计时
剧场版13：漆黑的追迹者