主要矿物成分为：石英，少数情况下可有水晶、玉髓、玛瑙、蛋白石、碧玉等；主要化学成分为：二氧化硅（SiO2）及三价高铁离子Fe+++；当为黑蜡石、灰蜡石、绿蜡石时，则含有分散状硫铁矿（FeS2,为具二价的低价亚铁离子Fe++）；当具有黑色树枝状、水草花状的“模树石”时，则含次生的硬锰矿（MnO2）。此外在花岗岩内或花岗岩接触带附近的黄蜡石，除了能含二价的低价亚铁离子Fe++ 和三价高铁离子Fe+++ 外，往往还含有微量的稀土元素。