接下来，G社更是在不断的继承与打破中挑战着人们的神经，且不说由胚胎状变成神经树状的第一使徒亚当，作为EVA中最让人咀嚼起来意味深长的人物加持良治似乎也从那个双料间谍的身份中脱离了出来。
接下来G社所在剧本和画面上呈现出来的小细节更是让人在会心一笑的瞬间让人心中一暖。完全照搬了新剧场版：序中葛城美里喝酒动作来隐喻这部作品的承接关系，让观众在明白了其中的意义后不禁在心中暗骂G社的偷工减料。而被真嗣看光了裸体样子后一脚飞踢的动作则让人想起了《新世纪福音战士：我的钢铁女友》中真嗣与明日香的开场。而明日香大骂着“色狼、变态、白痴”的样子与当年的明日香如出一辙的可爱娇蛮。
如果说15年前的EVA是在讲述人心之间厚厚的心之墙的话。那么15年后的EVA新剧场版正在试图打破那层存在于人心之中那堵厚厚的墙，也在试图打破由EVA这部作品创造的，难以超越的“墙”。
虽然决心打破以前的惯有认识，但是仍然需要有与前作之间产生联系，自闭懦弱的真嗣，自大孤独的明日香，以及不知人类感情为何物的凌波丽，所有的角色都一如原作一般。
如果除掉开场玛丽的登场，以及第七使徒的外形变化，几乎让人以为这又是在重制前作。
首先看到变化的竟然是所有人都没能预料到的凌波丽。在经历了与雷天使的战斗后，凌波学会了微笑。而在破中，真嗣对于凌波的体贴让凌波认识到了人与人之间的温暖，并对真嗣产生了情愫。
而真嗣在破一开场与父亲的对话中，也同样可以看出原作中那个懦弱的真嗣真真正正的在作为父亲的碇源堂面前所作出的改变。同时，对于碇源堂所说：“有些事情是绝对不能忘的。”产生了不同的理解。
外出郊游时，加持通过葛城美里的经历告诉了真嗣，大人们的世界同他们这样的少年所认识的不同。美里在被讨厌的父亲所救，然后为了了解那个自己所厌恶的父亲加入了NERV并继续父亲的工作。而真嗣也正在走上美里所走上的道路，通过驾驶EVA初号机去了解那个不被自己所理解的父亲，“‘活着’这件事情本身就包含很多意义”“能感受到痛苦的并不只有你一个人。”
第八使徒空天使入侵中，收获最多的可能不是因为变得坚强勇敢的碇真嗣，而是那个充满自信的明日香，作战的艰难致使一向自信的明日香真正的感受到了自己有多么的无力，对于朋友，同伴的也有了新的认识。
也正是出于此，明日香第一次试着对他人敞开心扉，不同于她初到日本对于一切外来事物的抗拒，面对着那个被自己鄙视的懦弱真嗣，明日香发现他并非想象中那样软弱无能，而自己也第一次了解了真嗣那个简单到单纯的愿望。“希望被父亲称赞”“也许父亲真的承认了我的能力了吧”原来他驾驶EVA并非和我一样是为了自己，EVA也可能成为维系自己与他人的纽带，至少对于碇真嗣是这样的。
这样的明日香在试着接受外来的朋友外，也在诊视着真嗣与自己所拉近的内心（这里指明日先不愿与桐木光分享真嗣制作的便当）。这可能也源自于互相将内心敞开（指对于驾驶EVA的初衷）后，对于对方的依赖。
另一个让跌破眼镜的事情莫过于凌波丽在接到真嗣送来的便当说出“谢谢”时的惊讶与柔和的眼神，甚至为了能让真嗣与父亲拉近关系而准备邀请大家一起吃饭。这可能是凌波自己都没能预料到的。在来到学校的时候说出的“早上好”更是让所有人都惊讶，甚至在真嗣关心她手上的伤的时，她会微笑着告诉真嗣，“秘密”。


不得不说，15年前，女神凌波丽以“无口、无心、无表情”的“三无少女”形象，在自闭与孤僻症横行的日本大环境下引起了普遍的关注和轰动，进而以该形象影响了整整一代人。如果说“女神”的诞生是在80年代那个特殊的大环境背景下造就的敲打人心的感动的话，那么所有关注EVA的人最期望的莫过于凌波丽真正获得，真正懂得人类的感情。这也是为什么在原作中凌波丽的微笑会成为EVA永恒的经典。随着《破》剧情的发展，虽然是那样的细微，但是凌波丽那张冰冷的脸上泛起越来越多的微笑却让所有期盼的人们为之心暖。“女神”固然是永恒的经典，但是当神折断了翅膀变成凡人时，那种发自心底的感动却让人久久不能平静。
首先发现凌波丽变化的是同为女生也对于真嗣存在情愫的明日香，看着她带着傲气做着料理决定与凌波一较高下，并被美里发现后慌张掩饰的样子，相信每个人都会会心一笑，然后从心底感叹：“虽然很想成为大人，但是其实还是个很可爱的孩子啊。”
然而凌波丽的邀请函和美里的解释却触动了明日香心底最深处的那根弦。就连那个没有感情的人偶都会为笨蛋真嗣着想，帮助他实现愿望啊。
四号机事故，二号机封印。明日香被无情的告知二号机谁都可以驾驶，这让一直以驾驶EVA作为人生价值存在的明日香备受打击。凌波丽告诉明日香，即使她不驾驶EVA其实也有自己的价值，并非如同自己一样必须靠驾驶EVA才能跟人们建立起联系与羁绊。
当缠满创可贴的手撑住了明日香飞来的巴掌时，凌波用自己的行动告诉明日香，也在告诉自己，自己并非是没有感情的人偶，她亦是一个活生生的有血有肉的人。而明日香也在与凌波的对话中真切的了解了凌波为了真嗣与碇源堂之间所做的无私付出。
三号机的大奖这次没有轮到铃原东治，却由明日香领走。理由，大概就是明日香从心底不希望因为三号机测试而影响到真嗣和父亲的聚餐吧。这可能也是明日香所能表现的，唯一可以媲美凌波丽的，属于她的温柔了吧。
从在松代，明日香与美里的对话中，明日香真切的表达着自己的情感，自己的曾经是有多么的孤独，而当她发现自己开始融入“大家”这个圈子时，也会以一种别样的“温柔”去体贴关怀他人。此时的明日香已经在《破》中完成了属于她的蜕变，不同于原作中那个在心中竖起厚厚高墙的脆弱女孩，真心与人交谈的明日香真正的发现了世界的美好，“是啊，我还是会笑的。”从明日香脸上流露出的微笑，在我的眼中，恍若化茧成蝶。
然而，当明日香坐上三号机的时候，每个人都知道，这将注定是一场悲剧。
EVA三号机连同乘坐在其中的明日香一起被确认为第九使徒霞天使。不敌使徒，真嗣又不愿意反击伤害明日香。碇源堂要求使用伪装操作系统，而剧情也被推向真正的高潮。不受控真嗣控制的疯狂的攻击着第九使徒，而真嗣虽然被屏蔽了视觉，但是与初号机建立的神经元仍然他真切的感受到初号机所做的一切，他也从感觉中猜到了初号机正在做着什么，奋力的反抗只是徒劳，真嗣只能徒劳的感觉着“口中”的三号机插入栓被初号机咬碎。
不得不说本段的确可以称得上是《破》中非常值得人们品味的经典。相较于原作中激昂的音乐以及真嗣直面友人被杀死的血腥，《破》中却在原作的基础上进行了让人眼前一亮的变化，《今日の日はさようなら》林原惠与童声合唱的背景音乐，在轻声吟唱着再会与永别的夕阳中，营造出一种残酷的美感，不禁让人想起明日香最后登上三号机时迷人的微笑。在真嗣歇斯底里的大喊中，一种揪心的疼痛，面对着自己渴望守护的东西被亲手撕碎的无力感，完美的营造出了真嗣面对父亲冰冷与残酷的绝望。凄美绝伦的歌词在描述着一个似乎永远不可能实现的美丽愿望“让我们好好珍惜，相互信任，所带来的喜，就在今日，你我分别，直到重逢那一日。”
也正是明日香的死（事后被证实并没有死亡）让真嗣明白了自己所有追求的，所要背负的事情。“父亲，我想要相信你，但你所做的一切都令我失望。”“明明自己也失去了重要的人！你明明应该了解的！”真嗣所在意的一切，却被自己所向往的父亲亲手撕碎。再次选择离开NERV的真嗣又一次的开始逃避残酷的现实。无法保护自己所在意的，并且全面否定了自己所向往的父亲，让真嗣的人生信念开始崩塌。就连那个从不离身，作为父亲象征的随身听也被他丢弃。


面对着美里的挽留，真嗣选择了再次将自己的心封闭起来，他听不进去任何事情。
“所以，我曾把自己的感受强加给你，我也知道你驾驶的时候是什么心情。”
“现在也知道你对驾驶EVA有多么的失望，”
“但是，就算如此，我还是相对你说……”
“其实，那提丽邀请了碇司令。”
“她是真的希望你和父亲能够和好，真嗣。”
“她是希望看到你们开心的在一起……”
美里没有让真嗣看到自己流泪的脸，她只想告诉真嗣，你做的真的很好。然而一切都无济于事。
第十使徒力天使，被誉为最强的使徒的降临将灾难降临第三新东京市。即使是启用了里模式THE BEAST舍弃了人类形态的二号机依然无法伤其分毫。而零号机更是以N²导弹直接冲击使徒的A.T.Field。
“碇君已经决定不再驾驶EVA了！所以……”
凌波丽在最后的时刻，带上真嗣所抛弃的随身听，带上了真嗣所抛弃的自己所背负的责任，以自己的生命去守护那个自己所珍视的碇真嗣所要保护的事物。
“撒，既然决定不驾驶了，你畏畏缩缩的躲在这里就一点意思都没有了。”
玛丽这样告诉不断逃避的真嗣。而那个为了守护真嗣所在意的一切的凌波丽，却在真嗣面前被使徒吞噬吸收。直到此时，真嗣才想起加持给予自己的嘱托，保护好葛城。
是的，自己的父亲舍弃了自己所珍视的，那么自己也要学他抛弃那些为自己努力的人们吗？答案是不能。葛城小姐还在NERV总部，曾经的友人也在那里，凌波被使徒抢走了。所有的一切让真嗣真正的觉醒了。
“把凌波……还给我！”
是的，为了死去的明日香，为了活着的人，也为了那个无私为自己付出的凌波丽。无论自己如何，无论世界如何，如果自己将那些守护着自己愿望的人也抛弃了，那么自己怎么可能称之为人！
“凌波就是凌波！”
真嗣大声的呐喊中，《翼をください》的映衬下。EVA初号机回应了真嗣的呐喊，以人类的愿望，成为神一般的存在，只为夺回那个属于人的本源——绝不舍弃所珍视的对方的决心。这便是人，这便是爱。
“凌波，关于父亲的那件事……谢谢你”
“对不起，我什么也没帮上忙。”
“没关系……这样就够了！”
以人的名义，不放弃，不逃避，以爱的名义，不放弃，不逃避……哪怕付出世界的代价，也要和你一起走向终结。
以爱上（你）的名义
后记：
如果说15年前的《新世纪福音战士》是在告诉人们，在那个80年代以自闭和自卑充斥的世界里，心之墙有多么难以打破。那么15年后，新剧场版则以续与破的形式，告诉我们生命应当向往何处。如同RE-TAKE中所提到的……如果不停的去逃避，那么将永远轮回于痛苦之中，唯有勇敢面对，才能真正得到解放。